一九五九年三月 拉萨爆发了战斗，达赖喇嘛和西藏地方政府 同叛乱分子串通起来，宣布了西藏独立。北京通知印度，说西藏地方政府 发动了武装叛乱，并保证 对西藏的 印度侨民提供保护。达赖喇嘛逃离拉萨，取道前往印度，他沿着古时的商路 越过麦克马洪线 到了达旺，在那里受到 印度政府的庇护。这些事件 引起全世界的注意，它对中印关系 马上起了直接的破坏作用。印度国内 对中国潜在的猜疑 再度出现。一九五O年 当中国军队开进西藏时 就已产生的种种疑虑不安，现在表现得更加强烈了。当初，人们就曾大肆批评 印度政府的政策，认为它 默许中国军队开进西藏；这时，反对 印度政府政策的呼声 又甚嚣尘上。印度各城市 举行了 声援西藏叛乱集团的 反华示威游行。四月间在孟买达到高潮。印度的社会党 在该市组织了一群人，将毛泽东的肖像 贴在中国总领事馆的墙上，向肖像上 乱掷鸡蛋和西红柿。中国 对之提出了 愤怒的抗议说，这是对“中华人民共和国元首……的莫大侮辱”。尼赫鲁当时 进退两难。几年来 对于西藏传来的 抵抗中国人的消息，印度政府总是 尽量冲淡，如可能 就不予发表，现在人们就可以指责他 故意装聋作哑。印度政界 普遍同情西藏人，特别是同情达赖喇嘛。尼赫鲁对此也有同感。但是，既然尼赫鲁 至少是从一九五O年 中国在西藏 重新行使权力以来 就已承认 中国对西藏享有主权，他也得承认：不管他和他的同胞们对西藏人怎样同情，西藏所发生的一切 乃是中国的事情——这肯定同印度官方 毫不相干。所以，他对中国采取照章办事的姿态，并试图以此 来平衡对 达赖喇嘛的 殷勤款待；他又斥责那些 上街示威游行和 发表愤怒演说的印度人 把他希望维持的 印中友好关系搞紧张了，以此来平衡他对西藏人 所表达的同情。毫不奇怪，他这种做法 讨好不了任何人。他拒绝随声附和 地谴责中国，印度 国内批评者 就责备他 对中国姑息；而中国 却攻击他 干预了中国的内政，甚至指责他 策动了西藏的叛乱。
北京多年来一直指责 印度利用噶伦堡 作为基地 来煽动西藏的叛乱。这个指责是很有道理的。早在一九五三年尼赫鲁曾经承认 噶伦堡是“一个特务窝子”。他说，那儿什么国家的特务都有，“而且有时候 我都怀疑 噶伦堡的大部分居民 是不是由外国特务 所组成的”。一九五六年 周恩来和尼赫鲁会谈时 对此提出不满。他说 美国特务 和其他特务 利用噶伦堡 从事破坏 中国在西藏的影响 的活动。一九五八年初，北京再度提出不满。周恩来接见 印度驻华大使时 提出了这个问题，中国政府随后 又发出照会，详尽地 叙述了噶伦堡的 西藏逃亡分子、美国和国民党特务分子的 “加紧活动”。中国说，这些分子 正准备在西藏 举行武装叛乱，企图使西藏 脱离中国。印度政府 答复说，中国必定是 依据不正确的情报，没有证据说明 外国利用噶伦堡 进行活动。然而，到了八月初，“在印度的 所有著名西藏官员，包括达赖喇嘛的哥哥 和噶厦的成员，以及作为 叛乱分子代表的 游击队头目，一道在噶伦堡 召开会议，起草了一份 向印度和联合国的呼吁书”。北京又提出抗议。一九五九年三月，中国宣称：最近在拉萨爆发的叛乱，是由噶伦堡的“指挥中心”策动的。 对西藏叛乱分子的 支援和指挥 显然是通过噶伦堡来的，而印度政府却 装作没看见。有证据说明 印度所起的作用 比这更积极一些。当时有个叫乔治·帕特森的英国人 住在噶伦堡，和西藏人有密切接触，他后来写道：一九五四年 有名印度官员找他，要他把一名叛乱头子 带到噶伦堡，“为西藏的独立进行工作”。
