Description

Broadの齋藤諒さん再登場。真核生物ゲノムにコードされたFanzorがRNAで標的をプログラム可能なエンドヌクレアーゼであることを示した論文、競合、ジョブハント、来年１月から理研で主宰予定のラボ運営方針について伺いました (8/31収録)

Show Notes (番組HP):

• 齋藤さん過去回 1 2
• 齋藤ラボ理研ECLページでの紹介
• 齋藤ラボ公募ページ（研究員・特別研究員）
• 齋藤ラボ公募ページ（パートタイマー・アルバイト）
• 理研　和光キャンパス　開拓研究本部
• トークしたイベント
• 濡木先生
• 西増先生
• 井上梓先生
• 古館昌平さんの回 1 2

論文パート

• Fanzor論文
• 最近のCell論文
• Feng Zhangラボ
• Cas9ゲノム編集論文
• Cas9ゲノム編集＠ヒト細胞 1 2
• Cas12
• Cas13
• Cas9祖先トランスポゾン論文
• Eugene Koonin
• OMEGA論文
• CASTホーミングについての齋藤さん前報
• 平野清一さんのIsrB構造論文
• ゲノム編集で病気も治るようになってきた
• トマトでGABAを増やす
• 魚で白身を増やす
• Jennifer Doudna達のFz論文
• IS (Insertion Sequence)：転移に最低限必要な酵素のみを内部にコードするトランスポゾンの一種。それぞれ番号がついていて、転移機構も色々。
• IS200/IS605
• IS607
• 2013年のFanzor命名論文
• AlphaFold
• Omar Abudayyeh（おまー）
• Jonathan Gootenberg（ぐーばー）
• 合同ラボ
• BioRxivのプレプリントHERMES
• Samuel Sternberg
• のHERMESイジり
• Science Advances論文
• TnpBのペーパー
• Virginijus Siksnys
• Kavli賞
• Soumya
• Han
• 毛みたいなほわっとしたカビ
• ATCC
• ツボカビSpizellomyces punctatus
• 濡木先生とSiksnysのTnpBの構造論文1 2
• 末端配列とガイドRNA(ωRNA)配列の関係：これのc
• Spuのめっちゃ綺麗な末端配列：これのa
• ツボカビにも一応エレクトロポレーションはある
• PAM(Protospacer Adjacent Motif)：CRISPR-Casシステムにおいて、Cas9などのエフェクターがDNA切断を行う際に、標的配列の隣に必要とするモチーフ。SpCas9では3’側にNGG。
• TAM(Target-Adjacent Motif)：OMEGAシステムには“Protospacer”という概念が存在しないため、このように呼ぶ。
• TAM、トランスポゾン、ガイドとなっている：これのa
• Peel-and-paste：これのb
• Sam SternbergのSelfish Spreadの論文（機構はFig. 5g）
• 転写因子(TnpB様の転写抑制因子)の論文
• OMEGAのペーパーが出た時のNews and Views
• Robert Desimone
• RSIの成果報告会で受賞したのが公表されたページ
• CSHLのCRISPR Meeting
• HanのTnpBのペーパー
• CRISPR nuclease-protease
• 加藤一希先生
• Jonathan StreckerとEsraのCRISPR associated endopeptidase論文
• StreckerのCAST論文
• Peiyu Xu
• Guilhem Faure
• COVID-19で一緒に働いた
• Julia Joungの転写因子アトラス
• Max WilkinsonのR2論文
• R2レトロトランスポゾンのレビュー
• R2を使った挿入ツール 1 2
• David Liu
• David LiuのtwinPE
• Omar + Goober のPASTE
• PASTEを基盤技術にしたTome Bioscienceの最近の動向
• Jonathan Weissman
• Cas活性のパラメータについての仕事の一例
• 登さん
• Deliveryの話、例えばコレ
• 昔のラボメンはK99取ってた
• マイキーのPEG10

ジョブハントパート

• 小関先生
• 医科研のUTOPIA
• 早稲田にいた時の自分の指導教官
• UTOPIAについて一応調べた（100日でワクチン開発でした。。。 by齋藤） 
• 東大の真下先生
• Cas3の論文
• 五神真先生
• 大阪大学の蛋白質研究所
• 定量研と卓越研究員制度
• 今年は加藤セチプログラムのみ
• Max君は本当にすごい
• Rockefellerインタビュー6人中2人がうちのラボ
• Kalli
• Helen Hay Whitney
• Hanna Gray
• Aviv Regev
• Xiaowei Zhuang
• Adam Cohen
• マイキーのラボ
• Max Wilkinsonの出身ラボ
• Kalliの出身ラボ

独立後の計画

• Joshua Weinstein
• DNA Microscopy
• Patrick Hsu
• Bridge RNA
• 宮脇さんが有識者の回
• 有識者会議
• 科研費倍増への運動
• 後藤由希子先生
• Kendall
• スイスで会ったギタリストの友達
• 本田圭佑
• HFSPミーティング
• 長田重一先生
• アポトーシスの写真
• 二階堂先生　ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
• 加藤英明先生　ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
• 奥山先生　ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
• Susan Gasser
• Patrick Matthias
• アセチル化やってた論文
• 吉田稔先生
• 古細菌テーマ＠HFSP
• 二段階になったHFSPフェローシップ申請（このReview Procedureタブを参照。Letters of IntentとFull Proposals）
• Yi Zhang
• 小嶋さん
• 寺坂さん
• 松田真弥さん
• 松本さん
• 古館さんのNature論文
• 長井淳さん　飲みましょう！！！（by齋藤）
• 齋藤さんMITのアドレス

Editorial Notes:

• 夢をみることができなければ、未来を変えることはできません。— 華麗なる一族（TBSテレビ, 原作・山崎豊子, 2007）（齋藤）
• 理研の現地インタビューも茶髪で乗り込んだのかどうか気になる (萩原)
• Shownotes大量に補足いただき大感謝です。今回もエナジェティックで非常に刺激を受けました、また是非！ (宮脇)