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A microbiota intestinal é à população de microorganismos, como bactérias, vírus e fungos presentes em todo o trato gastrointestinal, que tem como funções manter a integridade da mucosa e controlar a proliferação de bactérias consideradas perigosas, as bactérias patogênicas no organismo.

Algumas das bactérias que podem afetar o organismo entre elas a salmonella entérica, a listeria monocytogenes e as Staphylococcus aureus, que podem estar presentes em diversos alimentos como ovos, maioneses, frango, leite cru, leite pasteurizado, carnes de diferentes animais, vegetais, laticínios e produtos do mar.

A presença de microrganismos em grande quantidade, se tornam prejudiciais à saúde do homem, podendo provocar intoxicações alimentares. O vômito, a diarreia, a dor abdominal, a náusea e a febre são os sintomas mais comuns de infecções alimentares.