No intestino existem trilhões de microrganismos, bactérias, fungos e vírus. Esses micróbios são formados no corpo humano e são encontrados em diversas regiões vivendo em harmonia se a microbiota estiver em equilíbrio.
Esses microrganismos presentes na microbiota podem ser benéficos ou patogênicos para a flora intestinal, quando em desequilíbrio pode causar obesidade, doença inflamatória intestinal, infecções e doenças gastrointestinais.
As bactérias encontradas em maior número no intestino são, Lactobacillus, Bifidobacterium lactis, Prevotella, Bacteroides, Clostridium difficile e Escherichia coli.
O desequilíbrio da microbiota intestinal pode ser provocado por infecções, estresse, hábitos alimentares, doenças crônicas, atividade física, uso de medicamentos e qualidade e quantidade de sono.