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群体遗传学研究可以说是我们人类遗传学皇冠上的明珠,‘测通每一个人类’也是人类遗传学界的美好愿景。然而,这个愿景也让我们今天的群体遗传研究的雪球越滚越大,资源越来越集中,普通研究者越来越难参与其中。本期节目,我们来盘点一下今天的群体遗传研究已经卷到什么程度了,下一步的趋势是什么,应该如何破局~

一、经典 GWAS:卷到统计极限之后,开始卷表型

背靠背发表的 Nature Genetics 工作提示,GWAS 不再满足于“病例 vs 对照”,而是通过深度学习从 MRI 中提取连续端表型,并结合超大样本、多性状分析与 TWAS,把信号推向疾病发生之前的生理层级。

www.nature.com

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二、PRS:从“准不准”转向“什么时候还能用”

针对 2 型糖尿病的多祖裔 PRS 研究明确指出,PRS 的预测能力高度依赖人群背景和临床情境,标志着 PRS 研究从算法竞争转向临床边界、公平性与解释性问题。

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三、群体遗传新趋势:T2T 级别重写人群基因组

藏族三代测序构建近乎 T2T 的人群泛基因组,系统揭示了结构变异、重复序列和古人类引入序列在高原适应中的核心作用,显示 SNP-GWAS 触及不到的遗传层级正在成为新前沿。

www.biorxiv.org

四、古人类基因组:GWAS 的时间尺度被拉长

石峁古城的大规模古 DNA 研究通过亲属关系和群体结构重建,从遗传层面揭示史前社会组织与性别分工,表明遗传学已开始系统性回答社会与历史问题。

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五、GWAS × 单细胞 × 空间组学:走向“空间因果”

gsMap 方法将 GWAS 信号直接映射到空间转录组,在组织空间中定位与复杂性状相关的细胞,推动遗传关联从“基因—细胞”走向“基因—细胞—空间—功能”。

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