这篇文章介绍了一种名为压缩 Perturb-seq的新型基因筛选技术，它通过减少实验成本和规模来提高传统的 Perturb-seq 方法的效率。这种新方法通过两种实验策略实现压缩：细胞池化（将多个细胞放入一个液滴中）和向导池化（在单个细胞内引入多个向导 RNA），并结合 FR-Perturb 推理算法来计算性地解压测量结果，从而准确推断基因扰动效应。研究人员在人类巨噬细胞系中应用此技术对 598 个免疫相关基因进行了测试，证实了压缩 Perturb-seq 能够高效地识别免疫反应的关键调控因子，并能够提高发现遗传相互作用的能力。此外，研究还利用这些扰动数据，揭示了与人类疾病（如炎症和血液性状）遗传力相关的基因，但指出其结果与群体遗传学研究中发现的反式表达定量性状位点（trans-eQTLs）之间缺乏一致性。
References:
- Yao D, Binan L, Bezney J, et al. Scalable genetic screening for regulatory circuits using compressed Perturb-seq[J]. Nature biotechnology, 2024, 42(8): 1282-1295.
