这篇关于结肠衰老过程中组织和细胞时空动态变化的论文,主要介绍了作者构建小鼠结肠细胞和空间图谱的研究工作。研究团队结合了空间转录组学(spatial transcriptomics)和单核 RNA 测序(single-nucleus RNA-sequencing)数据,并开发了一个名为 cSplotch 的计算框架。该框架利用分层贝叶斯模型整合组织学特征与分子数据,以识别与年龄、解剖区域和性别相关的空间分辨细胞表达模式,从而深入理解大肠衰老过程中的细胞和分子变化。研究结果揭示了沿结肠轴向和隐窝轴向的细胞和分子梯度,以及与衰老相关的多细胞程序。
References:
- Daly A C, Cambuli F, Äijö T, et al. Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging[J]. Nature biotechnology, 2025: 1-13.