这项研究介绍了一种名为 IRIS 的计算方法，旨在更精确、高效地识别空间转录组学 (SRT) 数据中的组织结构区域。与传统方法不同，IRIS 创新性地利用单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据作为参考，直接建模组织内各区域特有的细胞类型组成特征。该方法不仅能整合多个组织切片的信息，还能跨越不同物种和技术平台，处理具有数百万个空间位置的大型数据集。通过对大脑结构、肿瘤微环境及病理变化的研究，证明了 IRIS 在识别生物学领域方面的准确率提升了高达 10 倍以上。同时，其运行速度较现有方法提升了数十倍乃至数百倍，为理解复杂组织的空间功能组织提供了强大的工具。
References:
- Ma, Y., Zhou, X. Accurate and efficient integrative reference-informed spatial domain detection for spatial transcriptomics. Nat Methods 21, 1231–1244 (2024). doi.org
