Życie w klasztorze nie było mu jednak pisane. Cesarz Nicefor I powołał go na zarządzającego największym przytułkiem dla ubogich w Konstantynopolu. Był to początek IX w. Po śmierci św. Terazjusza, patriarchy Konstantynopola, cesarz Nicefor I powołał Nicefora na patriarchę Konstantynopola. Wzbudziło to jednak sprzeciw, ponieważ Nicefor nie był duchownym, lecz laikiem. Cesarz jednak konsekwentnie podtrzymał swoja decyzję i Nicefor w roku 806 został patriarchą Konstantynopola. Otrzymał wtedy wszystkie święcenia.