El museo contempla una visión global de la región de Durango en sus diferentes aspectos: geológico, prehistórico, arqueológico y cultural a través de diferentes épocas: del periodo colonial al siglo XXI.
El museo cuenta con espacios dedicados a la cultura tepehuana y a Francisco Villa, así como con dos salas de exposiciones temporales.
En un recorrido a través de sus salas se podrá entender y reconstruir los distintos momentos del desarrollo de la región.